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Nagi nimmt Ruri mit in ihr chaotisches Labor an der Universität, wo sie Nagis Kollegin Yoko kennenlernt. Nagi hat eine Arbeit über den ungewöhnlichen Pyritkristall veröffentlicht, den Ruri in Episode 2 gefunden hat, und Ruri als Co-Autorin aufgeführt. Beim Aufräumen des Labors findet Ruri einen unwirklich anmutenden Wismutkristall. Nagi zeigt ihr, wie er hergestellt wurde. Ruri findet außerdem eine alte topografische Karte, die wertvoll ist, weil sie eine alte Mine zeigt, die auf neueren Karten nicht verzeichnet ist. Die drei Mädchen machen sich auf den Weg, um der Sache auf den Grund zu gehen. Ein Magnet hilft, Eisenerz im Abraumhalden zu identifizieren. Sie fallen in einen eingestürzten Tunnelabschnitt und müssen weitere Tunnel durchqueren, um zu entkommen. Nagis ultraviolette Taschenlampe enthüllt eine Galaxie bisher unbekannter Fluoritkristalle. Nagi ermutigt Yoko, eine Studie darüber zu leiten.